为了解决集装箱进出口不平衡的问题，船公司通常要向出口大于进口的地区调拨大量空箱。由于空箱的调拨要增加大量调拨成本，船公司在空箱调拨进口至空箱装货出口的过程中更应加强集装箱管理，避免超期箱的出现。在集装箱运输中空箱由进口到出口的整个流程可以归结如下： 　冷藏集装箱船舶进港→空箱卸船→码头堆存→集装箱车队拖箱→空箱进堆场→发货人提箱→装箱→重箱进港区→装船。

专为运输要求保持一定温度的冷冻货或低温货而设计的集装箱。它分为带有冷冻机的内藏式机械冷藏集装箱和没有冷冻机的外置式机械冷藏集装箱。适用装载肉类、水果等货物。冷藏集装箱造价较高，营运费用较高，使用中应注意冷冻装置的技术状态及箱内货物所需的温度。

机械式冷藏集装箱也有一些缺点：如设备复杂、初始投资大、维修费用高；箱内温度梯度要大于液氮冷藏集装箱；箱内需设风机、风道系统，会增加箱内货物的干耗、脱水。