冷冻集装箱（reefer container）分外置和内置式两种。温度可在-60℃ ~ +30℃之间调整。内置式集装箱在运输过程中可随意启动冷冻机，使集装箱保持温度；而外置式则必须依靠集装箱车、船和堆场、车站上配备的冷冻机来制冷。这种箱子适合在夏天运输黄油、巧克力、冷冻鱼肉、炼乳、 人造奶油等物品。

冷藏集装箱内的温升和温降速度与集装箱内装载的货物有关。当设定温度范围为-18℃±3℃时，容器内温度应保持稳定。然而，以下经验公式可作为计算冰箱未冷却时温升的标准值 1） 冷却货物（无通风）0.0054*（TW TN）℃/小时 2） 冷冻货物0.0067*（TW TN）℃/小时，其中TW和TN分别为外部温度和箱内温度。

冷藏集装箱是一种能保持设定温度的保温容器，主要运输冷冻食品。它是为运输鱼、肉、新鲜水果和蔬菜等食物而设计的。目前，国际上使用的冷藏集装箱基本上有两种：一种是机械冷藏集装箱，集装箱内装有冰箱；另一种容器没有冰箱，只有隔热结构，即在容器的端壁上有进气口和孔。箱体安装在机舱内，冷风由船舶制冷装置提供。这种集装箱称为离合器式冷藏集装箱（也称为外部或夹紧式冷藏集装箱）。