臭氧发生器的时间根据型号、产臭量的不同有所不一。通常来说，臭氧发生器消毒时间保持在25—40分钟为好。时间太短臭氧分子不能完全挥发，达不到消毒目的。如果时间超过一个小时以上容易有臭氧残留，需要开窗通风两个小时进行分子发散。

臭氧发生器在使用臭氧设备时，我们要注意一下事项：
1、臭氧浓度确保消毒作用
　　只要确保和其它消毒灭剂一样，只要到达足够的剂量，作用必定时间才干到达消杀作用。例如当臭氧浓度为0.08～0.6ppm时，对空气中细繁殖 体中的大肠杆作用30min，其平均杀灭率达84.60～99.9%，而空气中臭氧浓度为0.34～0.85ppm时，作用10～30min，其杀灭率 可达99.47～99.97%。又如臭氧对空气消毒时，当浓度为0.21mg/L时，作用10min对金黄色葡萄球杀灭率达90.81%，如进步浓度为 0.72mg/L时，作用时间仍为10min，杀灭率可达99.99%。一般讲臭氧的浓度愈高其灭作用愈好。
2、环境臭氧浓度不能过高
　　臭氧除了对人类有益的一面外，同时它又是一种对环境污染的物质，我环境空气质量标准(GB3095-1996)中规则臭氧的浓度限值(1小时平 均)一标准为0.12mg/m3;二标准为0.16mg/m3;三标准为0.20mg/m3。臭氧的工业卫生标准大多数地区高限值为 0.1ppm(0.20mg/m3)。因而使用臭氧消毒灭浓度不应过高，臭氧发生器的产值不是越高越好。例如：一般家庭用室内灭的臭氧发生器产值应在 200mg/h左右，高不要超过400mg/h。这样，在臭氧灭作业30～60min后，室内残余浓度低于果品家卫生标准要求。
　　该产品之所以能够在市场上大受欢迎，得益于臭氧强大的消毒功效，它的高氧化还原电位决定它在氧化、脱色、除味方面的广泛应用，有人研究指出，臭氧溶解于水中，几乎能够杀灭水中一切对人体有害的物质，比如铁、锰、盐、酚、苯、氧化物等，还可分解有机物及灭藻等。