要想有效地冷藏集装箱超期箱的产生就必须在上文所分析的，导致集装箱超期的环节上加强管理，全面提高各环节的工作效率。当然这其中存在许多客观因素，而不是船公司或任何其他行为主体所能决定的。但船公司可以通过激烈的市场竞争选择有利的合作方，通过相互间的密切合作来全面提高集装箱流转的效率。空箱卸船后，船公司及其代理应尽快完成进口空箱报关，然后委托车队拖箱。其中船公司的委托指令要及时发下以备车队去完成各项准备工作：如安排集装箱卡车领取设备交接单等。船公司在选择车队时应该以车队率的拖箱。

冷藏集装箱装箱前准备工作：根据不同易腐货物应确认下述事项：理想温度设定;新鲜空气换气量设定;相对湿度设定;运输总时间;货物体积;采用的包装材料和包装尺寸;所需的文件和单证等。 装箱前及装货时应注意：设定的温度应正确;设定的新鲜空气换气量应正确;设定的相对湿度应正确;装箱时制冷系统应停止工作;箱内堆装的货物应低于红色装载线和不超出T型槽的垂直面;箱内堆装的货物应牢固、稳妥;箱内堆装货物的总重量应不超过冷箱允许载重量;冷藏集装箱装货后总重量(包括附属设备的重量)在运输途中不应超过任一途经国的限重。

冷藏集装箱的货物检查，在装箱之前应对冷藏水果和蔬菜的温度以及冷冻货物的中心温度进行检测。还应检查水果和蔬菜是否存在比如发霉、枯萎、脱水、萎蔫、褪色、软点、破皮和脱皮、擦伤、冻伤和发臭等冷藏前的损坏。对于冷冻货物还应检查其是否有脱水、干燥、移位、发臭、黑斑和颜色改变，以及是否有因温度升高解冻后又重新冷冻的迹象。还应检查纸箱、托盘和其他包装物状况是否良好，是否能够在整个海运过程中保护货物状况。